Apa itu Pillar Oncoreveal?
Pillar Oncoreveal adalah teknologi baru yang membantu dokter mendeteksi kanker lebih awal dan merencanakan pengobatan yang lebih baik.
Bagaimana Cara kerja Pillar Oncoreveal?
- Mengamati DNA: Pillar Oncoreveal melihat kode genetik unik dari sel-sel kanker untuk memahami jenis kanker yang ada.
- Ambil Sampel Darah: Dengan hanya mengambil sedikit darah, Pillar Oncoreveal dapat menemukan jejak-jejak kanker yang terdapat di dalam tubuh.
- Machine Learning Algorithms: membantu menerjemahkan informasi DNA ini dan menyarankan cara terbaik untuk mengobati kanker.
Keunggulan Pillar Oncoreveal
- Menggunakan teknologi SLIMamp
- Fleksibel dengan adanya stopping points
- Library Preparation dan Sequencingpada platform Illumina
- Single-tube Multiplex PCR untuk efisiensi dalam mengaplikasikan secara simultan beberapa wilayah gen
- SLIMamp (Stem Loop Inhibition-Mediated Amplification) primer meningkatkan sensitifitas dan memastikan proses amplifikasi target yang difokuskan
Keunggulan teknologi SLIMamp
Teknologi SLIMamp (Single-Molecule Longitudinal Integrated Magnetic Amplicon) memungkinkan deteksi DNA kanker bahkan dalam jumlah yang sangat kecil, meningkatkan kemampuan untuk mendeteksi kanker pada tahap awal.
Dengan mengidentifikasi dan membedakan sinyal dari DNA kanker, teknologi SLIMamp mengurangi risiko kesalahan dalam diagnosa, memberikan hasil yang lebih akurat.
Penggunaan teknologi SLIMamp di Pillar Oncoreveal memungkinkan pengambilan sampel darah yang minim invasif, meningkatkan kenyamanan pasien dan memfasilitasi pemantauan yang lebih rutin.
Secara keseluruhan, uji ONCO/Reveal Multi-Cancer with CNV untuk mendeteksi ERBB2 CNV bekerja dengan baik dengan tingkat pemetaan 99,4% ± 2,1%, tingkat on-target 99,1% ± 0,4%, dan keseragaman cakupan lebih dari 0,2x rata-rata cakupan sebesar 93,5% ± 4,1% serta mendeteksi 100% (21/21) sampel negatif amplifikasi ERBB2 seperti yang dikonfirmasi oleh DISH.
Libraries were sequenced on an Illumina MiSeq
Kesimpulan dari uji ini: tes cepat dan efisien, bisa dimulai dengan hanya 5ng DNA dan hasilnya bisa didapatkan pada hari yang sama. Tes ini mendeteksi perubahan genetik kecil dengan sangat baik. Dengan mendeteksi berbagai jenis perubahan genetik, tes ini memberikan gambaran lengkap tentang mutasi dalam sampel, yang membantu dalam pengelolaan pasien secara klinis.
- Penelitian ini membandingkan kinerja Panel ONCOReveal Multi-cancer dari Pillar dengan Panel NGS lain dalam pengobatan kanker klinis. Perbandingan ini melibatkan 23 sampel kanker yang berbeda, yang memerlukan jumlah gDNA yang berbeda untuk masing-masing panel.
- Tingkat kesesuaian sebesar 92,5% diamati antara panel ONCOReveal dan CHPv2. Dua delesi satu pasangan basa dan satu varian nukleotida tunggal yang terdeteksi oleh panel Pillar tidak terdeteksi oleh CHPv2. Perbedaan frekuensi alel rata-rata antara kedua panel 1,8±1,5.
Libraries were sequenced on an Illumina NextSeq 550
Kesimpulan dari uji ini: Panel ONCOReveal Pillar efisien, sensitif, dan memiliki alur kerja cepat selama 6-8 jam, sehingga menjadi pilihan yang baik bagi laboratorium klinis untuk mengelola banyak sampel dengan kualitas yang bervariasi sambil memastikan pengurutan gen yang akurat dan terarah.
Panel ini menunjukkan 100% kesesuaian dengan metode sekunder, 100% repeatability, dan 100% reprodusibilitas. Memiliki sensitivitas 1% untuk JAK2 p.V617F dan 2,5% untuk varian lainnya dengan input DNA 40ng. Dapat menggunakan spesimen darah atau sumsum tulang yang disimpan pada suhu 4°C hingga 30 hari dan DNA yang disimpan pada suhu 2-8°C hingga 36 hari. Prosesnya otomatis, memungkinkan 93 spesimen diproses secara bersamaan. Panel ini, yang sekarang ditawarkan sebagai tes klinis, mengidentifikasi tingkat mutasi pada JAK2, CALR, dan MPL yang sebanding dengan tes mandiri, dan mengurangi waktu penyelesaian laboratorium sebesar 4 hari dibandingkan metode sebelumnya.
Libraries were sequenced on an Illumina MiSeq