Revolutionizing Disease Management with Modern Microbiological Approaches
ABL DIAGNOSTICS
ABL Diagnostics adalah perusahaan asal Prancis yang bergerak di bidang diagnostik molekuler, dengan fokus pada pengembangan dan penyediaan solusi lengkap untuk deteksi dan genotipe patogen melalui teknologi PCR (UltraGene®) dan sequencing (DeepChek®). Produk-produknya mencakup kit deteksi untuk virus seperti HIV, hepatitis, TB, dan SARS-CoV-2, serta perangkat lunak analisis bioinformatika seperti DeepChek®, ViroScore®, dan MicrobioChek®. ABL juga menawarkan layanan tambahan seperti kit pengumpulan spesimen (MediaChek®), sistem EMR (Nadis®), dan solusi otomasi laboratorium untuk meningkatkan efisiensi diagnostik klinis.
DeepChek™ Assay
DeepChek Assay adalah serangkaian kit reagen diagnostik molekuler yang dikembangkan oleh ABL Diagnostics (Advanced Biological Laboratories). Secara garis besar, produk ini adalah solusi hulu ke hilir yang dirancang untuk amplifikasi asam nukleat (DNA/RNA) guna memfasilitasi pembacaan urutan genetik (sequencing) pada patogen. DeepChek Assay digunakan secara luas dalam bidang mikrobiologi dan virologi (baik untuk keperluan diagnostik klinis maupun riset). Fungsi utamanya meliputi:
- Genotyping & Subtyping: Mengidentifikasi secara spesifik genotipe, subtipe, dan mutasi dari berbagai virus atau bakteri dalam sampel klinis pasien (seperti plasma, serum, atau darah lengkap).
- Deteksi Resistensi Obat (Drug Resistance): Ini adalah fungsi paling krusialnya. Assay ini mendeteksi mutasi genetik yang menyebabkan suatu patogen menjadi kebal (resisten) terhadap terapi obat tertentu, sehingga membantu dokter menyesuaikan regimen pengobatan (misalnya pada terapi ARV untuk pasien HIV atau terapi pengobatan Tuberkulosis).
- Target Patogen: Lini produk DeepChek sangat beragam, menargetkan patogen spesifik seperti:
- HIV-1 (Whole Genome, bagian PR/RT, maupun Integrase)
- Hepatitis C / HCV (bagian Core, NS5A, NS3, NS5B)
- Hepatitis B (HBV)
- SARS-CoV-2 & RSV (Respiratory Syncytial Virus)
- HPV (Human Papillomavirus)
- Tuberkulosis (untuk mendeteksi resistensi terhadap belasan obat TB)
- CMV dan HSV
Salah satu nilai jual utama DeepChek Assay adalah fleksibilitas sistemnya (open platform), yang dirancang kompatibel dengan dua teknologi pembacaan utama di laboratorium:
- Platform Next-Generation Sequencing (NGS): Kompatibel dengan ekosistem Illumina (termasuk mesin seperti seri MiSeq, MiniSeq, hingga iterasi terbarunya, MiSeq™ i100).
- Platform Sanger Sequencing (Elektroforesis Kapiler): Sangat kompatibel dengan instrumen sekuensing generasi sebelumnya
- Instrumen Hulu: Membutuhkan mesin ekstraksi DNA/RNA standar dan mesin Thermal Cycler (PCR) biasa untuk proses amplifikasinya.
- Integrasi Perangkat Lunak (Push-Button Bioinformatics): Reagen DeepChek dirancang berpasangan dengan DeepChek® Software. Laboratorium tidak perlu mempekerjakan ahli bioinformatika secara khusus; hasil mentah dari instrumen NGS/Sanger cukup dimasukkan ke dalam software, dan sistem akan otomatis mengeluarkan laporan mutasi genetik lengkap beserta interpretasi resistensi obatnya.
- Sensitivitas Sangat Tinggi: Terutama bila dipadukan dengan NGS, DeepChek Assay mampu mengidentifikasi varian patogen minor (populasi mutasi kecil yang bersembunyi di dalam sampel) dengan ambang batas (cut-off) deteksi serendah 3%. Ini jauh lebih akurat dibanding metode konvensional yang sering melewatkan mutasi kecil penyebab gagalnya terapi pengobatan.
- Format Sistem Terpadu (Multiplex): Beberapa varian assay menggunakan sistem single-tube (satu tabung) yang meminimalkan jumlah pemindahan cairan oleh teknisi, sehingga memangkas waktu kerja manual (hands-on time) dan menekan risiko kontaminasi silang.
- Validasi Penggunaan: Tersedia dalam versi CE-IVD (In Vitro Diagnostic tersertifikasi standar Eropa untuk diagnostik medis pada pasien) maupun versi RUO (Research Use Only / khusus digunakan untuk riset laboratorium murni).
