Pengertian
Pendekatan yang berguna untuk analisis sampel primer yang sama sekali tidak bias, sekuensing DNA/RNA shotgun (metagenomik atau metatranskriptomik) dari materi genetik yang ada dalam komunitas mikroba yang kompleks, seperti sampel lingkungan (misalnya, air limbah), mikrobioma manusia, dan sampel primer (misalnya, dahak, aspirasi pernapasan bagian bawah), dapat mengungkapkan komposisi tingkat spesies dari komunitas tanpa adanya informasi sebelumnya.
Keunggulan
- Metode bebas hipotesis untuk berbagai aplikasi dalam deteksi patogen
- Analisis dan interpretasi menyeluruh dari DNA atau RNA total dalam sampel mikroba yang kompleks
- Menyediakan cara untuk mempelajari mikroorganisme yang tidak dapat dikultur serta yang sulit atau hampir tidak mungkin untuk dianalisis
Produk
- What it does: Comprehensive sequencing of all genes in all organisms present in a given complex sample
- Method: Shotgun DNA sequencing (metagenomics)
- Recommended Sequencers: NextSeq 550 Series, NextSeq 1000 and NextSeq 2000 Systems, NovaSeq 6000 Series, and NovaSeq X Series
- Recommended Analysis Apps: DRAGEN Metagenomics Pipeline
- What it does: Fast, efficient depletion of undesirable host and pan-bacterial rRNA from complex microbial samples for metatranscriptomics applications
present in a given complex sample - Method: Shotgun RNA sequencing (metatranscriptomics)
- Recommended Sequencers: NextSeq 550 Series, NextSeq 1000 and NextSeq 2000 Systems, NovaSeq 6000 Series, and NovaSeq X Series
- Recommended Analysis Apps: Microbiome Metatranscriptomics App